MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE02

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012037	A	7	7	1	7	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012037	CACC	2	8	80	87	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_012037	ATT	2	6	115	120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012037	TTC	2	6	173	178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012037	T	6	6	220	225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012037	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012037	GGCA	2	8	334	341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012037	TCT	2	6	366	371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012037	TAG	2	6	448	453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012037	TC	3	6	466	471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012037	AGA	2	6	505	510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012037	TTTG	2	8	681	688	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012037	GCTCT	2	10	720	729	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_012037	GTA	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012037	CCGAG	2	10	867	876	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_012037	TGA	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012037	A	6	6	960	965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012037	C	6	6	1043	1048	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_012037	AC	3	6	1065	1070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012037	T	6	6	1084	1089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012037	GAT	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012037	CAAG	2	8	1145	1152	50 %	0 %	25 %	25 %	222530722
23	NC_012037	AG	3	6	1207	1212	50 %	0 %	50 %	0 %	222530722
24	NC_012037	GA	3	6	1221	1226	50 %	0 %	50 %	0 %	222530722
25	NC_012037	GA	3	6	1240	1245	50 %	0 %	50 %	0 %	222530722
26	NC_012037	AGG	2	6	1306	1311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222530722
27	NC_012037	AAGA	2	8	1434	1441	75 %	0 %	25 %	0 %	222530722
28	NC_012037	AGC	3	9	1442	1450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530722
29	NC_012037	GA	3	6	1524	1529	50 %	0 %	50 %	0 %	222530722
30	NC_012037	AG	3	6	1568	1573	50 %	0 %	50 %	0 %	222530722
31	NC_012037	ATC	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530722
32	NC_012037	GAA	2	6	1615	1620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222530722
33	NC_012037	GA	4	8	1740	1747	50 %	0 %	50 %	0 %	222530722
34	NC_012037	AG	3	6	1764	1769	50 %	0 %	50 %	0 %	222530722
35	NC_012037	GAAG	2	8	1773	1780	50 %	0 %	50 %	0 %	222530722
36	NC_012037	AGG	2	6	1830	1835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222530722
37	NC_012037	AG	3	6	1845	1850	50 %	0 %	50 %	0 %	222530722
38	NC_012037	GA	3	6	1884	1889	50 %	0 %	50 %	0 %	222530722
39	NC_012037	TCGT	2	8	1915	1922	0 %	50 %	25 %	25 %	222530722
40	NC_012037	ATC	2	6	2011	2016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530722
41	NC_012037	GTT	2	6	2091	2096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530722
42	NC_012037	A	7	7	2144	2150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012037	AT	3	6	2165	2170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012037	C	6	6	2171	2176	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_012037	T	6	6	2179	2184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012037	A	6	6	2241	2246	100 %	0 %	0 %	0 %	222530723
47	NC_012037	ATT	2	6	2327	2332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222530723
48	NC_012037	TCG	2	6	2345	2350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530723
49	NC_012037	CTT	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530723
50	NC_012037	CT	3	6	2439	2444	0 %	50 %	0 %	50 %	222530723
51	NC_012037	ACA	2	6	2545	2550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530724
52	NC_012037	CTG	2	6	2557	2562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530724
53	NC_012037	TTTC	3	12	2576	2587	0 %	75 %	0 %	25 %	222530724
54	NC_012037	CGA	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530724
55	NC_012037	TCT	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530724
56	NC_012037	GTT	2	6	2701	2706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530724
57	NC_012037	T	6	6	2777	2782	0 %	100 %	0 %	0 %	222530725
58	NC_012037	CAA	2	6	2881	2886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530725
59	NC_012037	T	6	6	2927	2932	0 %	100 %	0 %	0 %	222530725
60	NC_012037	TCGTAT	2	12	2957	2968	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222530725
61	NC_012037	GTT	2	6	2986	2991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530725
62	NC_012037	TGT	2	6	3005	3010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530725
63	NC_012037	GA	3	6	3020	3025	50 %	0 %	50 %	0 %	222530725
64	NC_012037	AATG	2	8	3079	3086	50 %	25 %	25 %	0 %	222530725
65	NC_012037	T	7	7	3168	3174	0 %	100 %	0 %	0 %	222530725
66	NC_012037	TCT	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530725
67	NC_012037	T	7	7	3204	3210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012037	A	6	6	3276	3281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012037	TAA	2	6	3296	3301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012037	TA	3	6	3360	3365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012037	AAC	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012037	CGCTGA	2	12	3421	3432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012037	CGT	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012037	TG	5	10	3535	3544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012037	CCTA	2	8	3547	3554	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012037	CA	3	6	3555	3560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012037	AAC	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012037	AAC	2	6	3601	3606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.